查閱文獻是了解科研進展最重要的途徑。在科研選題和規劃時,對研究項目的歷史和現狀,作全面查詢,了解前人已經做過的工作、取得的進展、成功的經驗和失敗的教訓,提出尚需探索的問題,同時避免和少走彎路減少重復性勞動,確保...[繼續閱讀]

    3.2.1.1中國期刊網全文數據庫(CJFD)CJFD(網址:http://www.cnki.net/index.htm)是由清華大學等主辦的,目前世界上最大的連續動態更新的中國期刊全文數據庫,收集了1994年以來國內公開出版的5300種核心期刊與專業特色期刊的全文,擁有全文文獻6...[繼續閱讀]

    3.2.2.1PubMed簡介PubMed(網址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed)是美國國家醫學圖書館(NLM)開發的基于網絡服務的查詢系統,可以免費查詢MEDLINE、OLDMEDLINE以及其他相關的數據庫。截至2004年10月,PubMed中共收錄了4465本期刊雜志,包括...[繼續閱讀]

    為有效地管理和利用參考文獻,美國ISIResearchSoft公司制作發行了三個商業軟件:EndNote、ReferenceManager和ProCite,研究人員可根據自己的喜好選擇使用。文獻管理器的主要功能:●可直接連接Internet進行文獻檢索,下載參考文獻記錄,包括作者、...[繼續閱讀]

    3.4.1.1dbEST簡介dbEST(網址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/index.html)是目前最大的一個公共功能性序列數據庫,是由NCBI于1992年開發的專門用于收集各個研究組織遞交的EST數據。截至到2004年10月15日,該數據庫中已有760多個物種的24,103,541條EST序列...[繼續閱讀]

    由于一個基因表達出的mRNA有很多,由此產生的EST數據就有非常大的冗余,為了解決冗余和重疊的問題,NCBI的科學家們開發了UniGene數據庫(網址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene)。UniGene自動地把GenBank中的序列分類,變成一個非冗...[繼續閱讀]

    1.http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_tutorial/m1001.html2.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/journals/noprov/loftext_full_noprov.html3.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/dbEST_summary.html4.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene5.http://ww...[繼續閱讀]

    大規模測序得到原始的EST序列要先經過序列前處理。序列前處理是將原始序列中可能存在的污染、載體序列以及那些不考慮分析的序列(如線粒體、葉綠體、rRNA等)進行標記和屏蔽,使分析的序列比較“干凈”;該步驟通常采用序列比對...[繼續閱讀]

    Phrap是一個基于swat算法,對霰彈法測序的DNA序列來進行組裝的軟件,在Unix的操作系統下運行。它的獨特之處在于有較高的精確度,可以利用整個reads,而不僅僅是修整過的高質量的部分來組裝;它尋找序列間的重疊(overlap)部分,將高質量嵌...[繼續閱讀]

    CAP3是一個應用于序列組裝的程序,屬第3代的CAP組裝軟件,較以前的版本有了一些改進:它能消除3′和5′端的低質量區域;在計算read之間的重疊時使用堿基質量信息來構建多序列的聯配,從而產生一致序列,也可以利用正反向的關系確認和...[繼續閱讀]